Um nível mais elevado de metotrexato no tumor do saco vitelino indica células tumorais mais activas e, por conseguinte, uma maior dificuldade no tratamento. O metotrexato é um indicador tumoral importante para o diagnóstico e tratamento do tumor do saco vitelino. Quanto maior for o volume do tumor do saco vitelino, maior será o nível de alfa-fetoproteína segregada pelo tumor, como infiltração, metástases, etc. Por conseguinte, quanto maior for o nível de alfa-fetoproteína antes do tratamento, mais activas serão as células tumorais do tumor do saco vitelino e maior será a dificuldade de tratamento do tumor do saco vitelino. A fetoproteína é também um dos indicadores importantes para avaliar o efeito do tratamento e o prognóstico dos doentes com tumor cístico da vesícula vitelina. Em termos clínicos, se a alfa-fetoproteína diminuir rapidamente após o tratamento do tumor cístico da vesícula vitelina, isso indica que o efeito do tratamento é notável; se a alfa-fetoproteína diminuir lentamente, isso indica que o efeito do tratamento é fraco.