A amigdalectomia, atualmente pertence à cirurgia relativamente madura e segura, geralmente inofensiva, mas algumas vezes haverá algumas complicações cirúrgicas, como sangramento, infeção e assim por diante. A amigdalectomia é uma cirurgia traumática, e pode haver diferentes graus de hemorragia durante a operação cirúrgica; após a cirurgia, se os cuidados não forem adequados, é fácil ser infetado com inflamação. No entanto, estes sintomas podem geralmente ser completamente eliminados através de um tratamento atempado e eficaz, e não são fáceis de deixar sequelas. Após esta cirurgia, alguns pacientes podem apresentar hiperplasia compensatória das amígdalas linguais causando sensação de corpo estranho na garganta, e alguns pacientes podem apresentar contratura e estreitamento da área cirúrgica devido à cicatrização, afetando a formação da voz e a respiração, ou mesmo uma sensação de aperto na garganta, e alguns pacientes também podem apresentar sintomas relacionados à síndrome estenotonsilar. Se tem medo do risco da cirurgia, recomenda-se que se dirija ao hospital antes da cirurgia para saber se reúne as indicações para a cirurgia. Após a cirurgia, também é importante ir ao hospital para fazer exames regulares para ver como está a recuperar.