Para a terapia de respiração assistida por ventilador, existem ventiladores não invasivos e invasivos. No caso da utilização de ventiladores não invasivos, a respiração espontânea do doente não é afectada. No caso dos doentes com entubação traqueal com respiração assistida por ventilador invasivo, a retoma da respiração espontânea depende principalmente da doença primária do doente e da gravidade da doença. No caso de doentes com doença pulmonar obstrutiva crónica, asma e pneumonia grave, os doentes podem recuperar a respiração espontânea com um controlo agressivo da doença primária e ventilação assistida por ventilador. Estes doentes não devem ser submetidos a um modo de ventilação controlada durante um longo período de tempo para impedir a respiração espontânea do doente, caso contrário será difícil recuperar a respiração espontânea e ocorrerão dificuldades de descondicionamento. Nas lesões neuromusculares, nos traumatismos craniocerebrais graves, especialmente nas lesões do tronco cerebral, a respiração espontânea é difícil de recuperar devido ao comprometimento do centro respiratório e do impulso respiratório, e apenas uma minoria de doentes consegue recuperar parte da sua respiração espontânea alternando entre os modos de ventilação controlada e assistida através do ventilador.