A melatonina e o álcool não devem ser tomados em conjunto. Embora o álcool e a melatonina não produzam efeitos adversos significativos quando ingeridos em conjunto, a ingestão de ambos tende a afetar a eficácia do medicamento, o que, por sua vez, afecta a sua ação.
A melatonina é uma hormona endógena do corpo humano, está familiarizada com a função de pode melhorar a qualidade do sono, pode encurtar o tempo de vigília antes de deitar e o tempo de adormecer, melhorar a qualidade do sono, as pessoas geralmente tomam melatonina exógena para promover o sono, depois de tomar o medicamento no sono do número de despertares é reduzido, o estágio de sono leve torna-se mais curto, o estágio de sono profundo será prolongado, no ajuste do jet lag também tem um certo efeito.
O álcool tem o efeito de excitação dos nervos, fácil de levar a insónia, distúrbios neuroendócrinos, por isso é melhor não beber durante a medicação.