Os pacientes com fibrilação atrial não são normalmente recomendados para hospitalização, mas no caso de fibrilação atrial do primeiro episódio, recomenda-se que a hospitalização seja seguida de uma busca cuidadosa da causa, quer seja devido a hipertiroidismo ou causado por doença cardíaca ou envelhecimento, pelo que a fibrilação atrial do primeiro episódio é normalmente hospitalizada. Além disso, os pacientes devem também ser hospitalizados se tiverem um AVC ou insuficiência cardíaca, pelo que o tempo de hospitalização dos pacientes com fibrilação atrial não pode ser generalizado. Em pacientes com fibrilação atrial paroxística comum, a ablação por radiofrequência pode ser considerada após tratamento comum e se não houver trombo no ultra-som de esófago. Os doentes com fibrilação atrial persistente ou aqueles que já têm trombo de orelha esquerda podem precisar de ser hospitalizados por um período de tempo após tratamento formal como a anticoagulação e terão de ser mantidos fora do hospital por mais um período de tempo. Se os resultados forem maus e for necessária uma segunda hospitalização para ablação, ou se o paciente estiver em alto risco de trombose e não desejar tomar anticoagulantes, a oclusão do ouvido esquerdo pode ser realizada para evitar que o trombo provoque uma embolia cerebral. Isto porque a embolia cerebral por fibrilação atrial tem um mau prognóstico, com uma elevada mortalidade e taxa de recorrência, e é facilmente fatal e incapacitante. Por conseguinte, o tempo de hospitalização varia em função do objectivo da hospitalização, do tipo de fibrilação atrial e da escolha do tratamento, e não pode ser generalizado.