A sífilis tem um determinado período de incubação após a infeção, uma vez que a constituição de cada pessoa é diferente, o tempo exato para o aparecimento dos sintomas varia de pessoa para pessoa, sendo que a maioria dos doentes apresenta sintomas em cerca de 2-4 semanas. A maioria dos doentes apresenta os sintomas em cerca de 2 a 4 semanas, mas alguns doentes podem apresentar os sintomas em meses ou mesmo anos. Depois de o corpo ser infetado com a espiroqueta da sífilis, há normalmente um período de incubação antes de aparecerem nódulos e úlceras localizadas. A duração deste período de incubação varia de pessoa para pessoa, podendo ser tão curto como 10 dias ou tão longo como 90 dias, com uma média de 21 dias, ou cerca de 2-4 semanas, altura em que a espiroqueta da sífilis pode causar contacto local e danos na pele no local de invasão. É claro que há alguns doentes que podem estar infectados com as espiroquetas da sífilis durante muito tempo sem quaisquer manifestações clínicas, e só através de análises ao sangue para deteção da sífilis é que se descobre que o doente está infetado, o que se designa por sífilis latente ou sífilis oculta. É mais difícil determinar o momento em que os sintomas aparecem nestas pessoas, alguns podem demorar alguns meses, outros até mais do que alguns anos. Se um doente tiver comportamentos de alto risco e estiver preocupado com a possibilidade de contrair sífilis, recomenda-se que se dirija ao hospital a tempo de fazer um exame claro para evitar atrasar o seu estado.