Os doentes com síndrome de hipoventilação por apneia do sono terão múltiplos danos sistémicos nos seus corpos devido à hipoxia durante a noite, incluindo o sistema nervoso, o sistema cardiovascular, o sistema respiratório, o sistema endócrino, etc. Danos a vários sistemas aparecerão doenças correspondentes: 1, o sistema nervoso central: haverá acidente vascular cerebral inexplicável, incluindo hemorragia cerebral, infarto cerebral, e o tempo vai até aparecer doenças neurodegenerativas, e até mesmo disfunção cognitiva; 2, o sistema cardiovascular: pode ser mais amplamente conhecido, incluindo hipertensão, especialmente pressão arterial persistente, angina pectoris, insuficiência cardíaca congestiva, arritmia cardíaca, e assim por diante; 3, o sistema respiratório: os pacientes sempre se sentem sem fôlego à noite, o tempo causará ritmo respiratório ou distúrbios neurológicos; 4, o sistema endócrino: doenças relacionadas ao sistema metabólico, como diabetes mellitus, etc., podem estar associadas à síndrome da apneia hipopneia do sono.