As isoenzimas são um subtipo de creatina quinase e são mais específicas do que a creatina quinase para o diagnóstico de miocardite ou enfarte do miocárdio. Se um doente tiver uma isoenzima de creatina quinase elevada, são necessários outros testes de troponina I ou troponina T para avaliar a presença de enfarte agudo do miocárdio em conjunto com os sintomas reais do doente e a evolução dinâmica do ECG. Os isoenzimas são de grande importância clínica, uma vez que ajudam a determinar se ocorreu um enfarte do miocárdio e também a avaliar a extensão do enfarte do miocárdio em curso. Se o doente não tiver uma isoenzima elevada no início da angina, recomenda-se que o teste seja repetido após 3-4 horas.