A transferência de ciclo natural de embriões congelados requer a aplicação de progesterona para manter a gravidez após a transferência. A transferência de ciclo natural é indicada para pacientes com ovulação normal. A monitorização folicular é efectuada nos dias 10-12 da menstruação para induzir o aumento folicular e, após a rutura natural dos folículos e a preparação do endométrio com progesterona, os embriões descongelados são transferidos para a cavidade uterina. No caso de pacientes com ovulação anormal, a transferência de embriões congelados não pode ser realizada num ciclo natural. Para as mulheres com níveis baixos de estrogénio e progesterona, é necessário um suplemento de progesterona após a transferência para manter a gravidez. O momento exato da transferência de embriões congelados depende do tipo de embrião. A melhor altura para transferir embriões em fase de clivagem é o terceiro dia após a ovulação. A melhor altura para a transferência de blastocistos é cerca de cinco dias após a ovulação. As mulheres que necessitam de reprodução assistida são aconselhadas a visitar um centro especializado em medicina reprodutiva.