Tanto o HPV de baixo risco como o HPV de alto risco podem voltar a ocorrer. A recorrência do HPV de baixo risco é principalmente causada por verrugas tipo 6 e 11 que são propensas a recorrência, pelo que é importante seguir após o tratamento e não ter relações sexuais até que os laboratórios se tenham tornado negativos. A principal razão para a recorrência da infecção por HPV de alto risco é a actividade sexual, e ter relações sexuais pode causar a recorrência da infecção por HPV de alto risco. Se tiver tido infecção por HPV de alto risco no passado e tiver sido tratado em conformidade, recomenda-se também um acompanhamento regular. É muito importante que as mulheres sejam rastreadas uma vez por ano para o cancro do colo do útero e que lhes seja dada a devida atenção.