A maioria dos casos de menstruação sem descida da temperatura corporal basal deve-se a uma atrofia luteal incompleta. Por várias razões, o eixo hipotálamo-hipófise-ovário é interrompido ou o mecanismo luteinizante é anormal, resultando no corpo lúteo não atrofiando no tempo, o endométrio ainda será afetado pela progesterona, de modo que o endométrio não pode ser completamente derramado, o paciente terá menstruação prolongada e a temperatura não pode ser completamente reduzida. O endométrio pode ainda ser visto como uma reacção secretora. Por conseguinte, se uma mulher tiver períodos prolongados, precisa de ser tratada com medicação oral de progestina sob controlo médico.