O facto de os medicamentos antivirais funcionarem bem no primeiro mês e depois se tornarem menos eficazes no segundo mês pode estar relacionado com o desenvolvimento de resistência aos medicamentos e com uma exacerbação da doença. Quando os medicamentos antivirais apresentam uma diminuição da eficácia no segundo mês de tratamento, a primeira consideração é o desenvolvimento de resistência aos medicamentos. Quando o vírus no organismo desenvolve anticorpos contra o mesmo medicamento durante um longo período de tempo, a diminuição da eficácia do medicamento é designada por resistência ao medicamento. Para além disso, pode dever-se ao agravamento da doença. Se o medicamento escolhido não matar o vírus de forma direccionada, pode ter algum efeito no início, mas à medida que o vírus continua a multiplicar-se, o nível de vírus no organismo aumenta e o estado da doença agrava-se. Nesta altura, o efeito de continuar a utilizar os medicamentos deteriora-se obviamente, é necessário consultar um médico atempadamente, efetuar testes de sensibilidade aos medicamentos e outros testes, sob a orientação do médico para efetuar o tratamento.