A avaliação da função sexual após a hipospádia é principalmente nas áreas da libido, qualidade de vida sexual, ejaculação e fertilidade. Em termos de desejo sexual, a maioria da literatura não relata qualquer diferença significativa entre os períodos pré e pós-operatórios, enquanto que alguma literatura relata uma diminuição do desejo sexual em 10% dos pacientes após a cirurgia. Em termos de qualidade de vida sexual, alguns compararam as hipospádias pós-operatórias com a pós-circuncisão e não houve diferença significativa, mas se houve complicações do procedimento na altura, o impacto na função sexual foi significativamente aumentado. Os principais efeitos na função sexual são a insatisfação com a aparência, a recurvatura peniana, erecções dolorosas e disfunção eréctil, sendo o tipo proximal (raiz peniana, escrotal, perineal) mais afectado do que o tipo distal (coronal, corpus penis). As perturbações ejaculatórias pós-operatórias são um factor que afecta a função sexual e reprodutiva do paciente, sendo as causas potenciais: próstata imatura, obstrução da vesícula seminal, diverticulum uretral, etc. Relativamente pouco tem sido relatado no que diz respeito à função reprodutiva. Uma cirurgia bem sucedida é, portanto, a base para uma vida feliz, e o acompanhamento profissional, a avaliação e o tratamento abrangente são a garantia.