Hipospadias é derivado da palavra grega hypospadias, que é uma combinação das palavras por baixo e fenda. Segundo o médico romano Vine, esta anormalidade da uretra foi descrita e nomeada pela primeira vez por Grimm já no século II d.C. Quando o feto atinge as 6 semanas de idade, aparece o nódulo genital, que é a base da glande masculina e do clítoris feminino. Abaixo do nódulo genital, nasce um par de pregas uretrais paralelas, entre as quais se forma o sulco uretral, e junto à parede de cada prega há um inchaço dos lábios escrotos, que formarão os lábios maiores femininos ou escrotos masculinos. No feto masculino, com 8-10 semanas, as dobras uretrais atravessam a ranhura uretral e gradualmente a fenda suburetral.