Se a lesão cancerosa for pequena e não tiver metástases nos gânglios linfáticos, pode ser tratada por dissecção endoscópica da submucosa, ao passo que a ressecção gástrica é recomendada se a lesão for grande. Os doentes com carcinoma da submucosa gástrica são tratados principalmente por cirurgia e os seus métodos cirúrgicos dependem das condições dos doentes, incluindo principalmente a dissecção endoscópica da submucosa e a gastrectomia cirúrgica. No caso de cancro gástrico precoce com pequenas lesões cancerosas, diâmetro inferior a 3 cm, profundidade de infiltração inferior a 500 μm e sem metástases nos gânglios linfáticos, a dissecção endoscópica da submucosa pode ser considerada para evitar a ressecção gástrica. Se o cancro for de grande dimensão e sem metástases, pode ser realizada uma gastrectomia radical; se o doente for acompanhado de metástases à distância, pode ser realizada uma gastrectomia paliativa. Recomenda-se aos doentes com carcinoma submucoso gástrico que procurem tratamento médico atempadamente e recebam tratamento de forma ativa para evitar atrasar a doença.