As diferenças entre a RM e a TC são as seguintes: 1) diferentes princípios de imagem; 2) diferentes efeitos de observação por imagem; 3) diferentes tempos de exame, a RM demora mais tempo, a TC demora menos; 4) a RM está contra-indicada para alguns pacientes, pacientes com objectos incorporados, dispositivos electrónicos, implantes cocleares, etc. não estão autorizados a entrar no campo magnético; 5) diferentes itens vantajosos, a RM tem vantagens para tecidos moles e ossos, a TC tem vantagens para os pulmões e órgãos das cavidades.