A profilaxia perioperatória, principalmente sob a forma de antibióticos pré-operatórios administrados por via intravenosa ou tópica, tem como objectivo evitar a contaminação da incisão, bem como dos órgãos durante a cirurgia. Os princípios da profilaxia requerem atenção ao tipo de cirurgia, ao grau de trauma e às bactérias que o podem contaminar, à susceptibilidade aos fármacos e ao princípio de utilizar, o mais isoladamente possível, os fármacos mais fortemente dirigidos contra as bactérias contaminantes. Para os procedimentos transdérmicos, podem ser escolhidos fármacos mais sensíveis ao Staphylococcus aureus; para os procedimentos transcolorectais, podem ser escolhidos fármacos sensíveis aos bacilos gram-negativos intestinais. Administrar no prazo de 0,5-1 hora antes da incisão cirúrgica da mucosa da pele.