O exame de rotina da enterite crónica não é um diagnóstico definitivo, mas pode dar algumas indicações, como o aumento de leucócitos nas fezes de rotina, o que pode indicar uma lesão inflamatória. A presença de sangue oculto nas fezes de rotina indica um distúrbio hemorrágico, e a natureza da lesão também pode sugerir enterite crónica e alguns tipos específicos de enterite. Mas para diagnosticar o tipo específico de enterite, recomenda-se a realização de uma colonoscopia para esclarecer as doenças relacionadas, o estado da mucosa intestinal, se necessário, pode ainda fazer uma biópsia patológica, esclarecer a natureza da enterite. Assim, a enterite crónica deve ser verificada também de acordo com os sintomas, sinais e combinada com testes laboratoriais relevantes, avaliação abrangente, para determinar o diagnóstico de enterite crónica e tipos específicos de enterite.