O principal sintoma das úlceras duodenais é a dor na parte superior do abdómen, que pode ser baça, ardente, inchaço, dores agudas e desconforto semelhante ao da fome. A dor ocorre tipicamente no estado de jejum, ou seja, de estômago vazio antes de uma refeição, e pode ser aliviada comendo, ou comendo alimentos alcalinos, tais como bolachas de refrigerante. Os pacientes sentem frequentemente dores entre as 10 e as 11 horas e entre as 16 e as 17 horas. Também pode ocorrer à noite com o estômago vazio, especialmente na parte final da noite, e muitas vezes acorda com dor. A dor é geralmente ardente ou baça e “rítmica”, isto é, “aliviada da dor”. A dor pode por vezes irradiar para a área correspondente das costas. Pode ser acompanhado de refluxo ácido, vómitos e distensão gástrica. O doente típico tende a ter um padrão sazonal de dor abdominal, ocorrendo no Outono, Inverno ou Primavera de Inverno, e não é raro que a dor se repita e se resolva ao longo de vários anos. Isto é conhecido como dor “cíclica”. Pode resolver por si próprio. Há um medo de comer alimentos e bebidas frias, e uma preferência pelo calor e pela pressão. A dor agrava-se quando se bebe álcool ou se come de forma incontrolável. É pior com o stress e o esforço. Alguns doentes com úlceras duodenais experimentam hemorragias no tracto digestivo quando a úlcera corrói os vasos sanguíneos. As úlceras são a causa mais comum de hemorragia gastrointestinal superior nos humanos, e a hemorragia pode estar associada a vómitos de sangue, fezes negras, etc., requerendo tratamento de emergência. Em casos graves, pode ocorrer perfuração e o início súbito de dor abdominal grave, que é insuportável, pode também requerer tratamento de emergência. Alguns doentes apresentam hemorragias e perfurações no seu primeiro ataque de úlcera. Um pequeno número de doentes com úlceras duodenais são assintomáticos e são “úlceras silenciosas”. Estas úlceras são mais susceptíveis de desenvolver complicações. Portanto, embora as úlceras duodenais tenham sintomas típicos, não podem ser detectadas apenas pelos sintomas e o diagnóstico clínico ainda depende da gastroscopia.