Um cisto epiglótico geralmente não apresenta inchaço por cerca de 21 dias após a cirurgia.
A cirurgia para os quistos da epiglote é tratada principalmente através da remoção da tampa superior da parede do quisto e, em seguida, da destruição da parede basal do quisto com laser ou electrocauterização ou, no caso de quistos recorrentes ou grandes, é realizada uma faringotomia lingual meconial para remover completamente a parede do quisto. A cirurgia causa frequentemente incómodo e irritação nos tecidos soltos circundantes, e a área operada tende a apresentar vários graus de edema no período pós-operatório.
O processo de reparação do trauma pós-operatório demora geralmente cerca de 1 semana para cicatrizar a ferida, 1 semana para o crescimento competitivo da mucosa e 1 semana para a redução do edema. A recuperação inicial do epitélio da mucosa é concluída em cerca de 3 semanas e demora cerca de 1 mês para o regresso completo ao normal, enquanto o fim do período de edema demora frequentemente cerca de 21 dias.
O período de recuperação do cisto da epiglote requer dieta semi-líquida, para cistos enormes, devido ao escopo mais amplo da operação e trauma mais profundo, é necessária dieta líquida, entretanto, mantendo a cavidade orofaríngea limpa, evitando estimulação picante e ingestão de alimentos duros, para reduzir a ocorrência de sangramento pós-operatório, infecções e outras reações adversas, de modo a evitar atrasar o período de recuperação e afetar o reparo dos tecidos.