O parasita pode entrar no cérebro, que é conhecido como parasitose cerebral, uma vez que o corpo do parasita, ovos ou larvas invadem os tecidos do cérebro e mais tarde causam sintomas que podem levar a uma série de reacções imunopatológicas. Clinicamente, os pacientes podem apresentar meningoencefalite aguda ou convulsões, aumento da pressão intracraniana, edema cerebral e outros problemas. Os sintomas de infecção parasitária do cérebro dependem da localização, extensão e número de parasitas e do grau de comprometimento da circulação do líquido cefalorraquidiano. O tratamento deve ser diagnóstico precoce e o controlo do estado do paciente. Os pacientes podem ser tratados usando medicamentos antiparasitários, dependendo do tipo de parasita. Clinicamente, no caso de cisticercose em suínos, os doentes recebem tratamento de desparasitação.