A pomada eritromicina não deve ser aplicada no fundo da cavidade nasal. Se for causada por inflamação e erosão da membrana mucosa na rede capilar na frente do septo nasal, pode ser aplicada com moderação com pomada eritromicina. Se a cavidade nasal for preenchida após cirurgia nasal ou sinusal, a superfície do enchimento pode ser revestida com pomada de eritromicina. Como existem cílios na superfície da mucosa nasal, a aplicação frequente de drogas à base de pomada pode afectar o movimento dos cílios da mucosa nasal. Além disso, devido à complexa anatomia da cavidade nasal e à inflamação profunda da cavidade nasal, não é possível aplicar uniformemente eritromicina e outras pomadas anti-inflamatórias em toda a mucosa nasal, pelo que para a cavidade nasal e seios nasais, os sprays nasais são a base da medicação.