Em geral, a infusão de epididimite aguda pode ser eficaz em 1 a 2 dias, o que pode variar consoante o estado e o físico do indivíduo e a sensibilidade ao medicamento. A epididimite aguda pode ser eficaz com medicação durante cerca de 1 a 2 dias, como a redução da dor e do inchaço do epidídimo e o alívio da febre. A epididimite aguda é tratada principalmente com antibióticos. Os medicamentos mais utilizados são as cefalosporinas, as quinolonas, os macrólidos, etc. A epididimite sexualmente transmissível é tratada principalmente com antibióticos de cefalosporina, que podem ser adicionados à levofloxacina e à doxiciclina, etc. A epididimite causada pela infeção por E. coli é tratada principalmente com ofloxacina ou levofloxacina. Os medicamentos acima referidos devem ser utilizados sob a orientação de um médico.