As biópsias de perfuração são geralmente inofensivas. A agulha de perfuração é oca com uma fenda no meio e uma ponta biselada, o que normalmente não causa hemorragia durante a perfuração. A punção é geralmente guiada por ultra-sons ou TAC para assegurar que o local da punção é preciso. Durante a punção, é mais provável que ocorra hemorragia. Como as agulhas utilizadas para a punção são relativamente finas, incluindo principalmente modelos de 0,9mm, 1,22mm e 1,6mm, podem causar menos danos e geralmente não levam a grandes hemorragias. A agulha de punção de 1,22mm é geralmente escolhida para furos, que são realizados sob orientação de ultra-sons ou TAC. A fenda na agulha contém uma certa quantidade de tecido patológico removido, que é examinado patologicamente, e os achados patológicos são benignos ou malignos, o que determina o plano de tratamento final.