Se ainda sentir diarreia após tomar medicação anti-diarreica, deve considerar que pode ser causada pelo uso impróprio de medicação pelo paciente. A diarreia é principalmente causada por perturbações da flora intestinal, pelo que o tratamento requer o uso de medicamentos que regulam as perturbações da flora intestinal, tais como probióticos, que podem desempenhar um papel na inibição da reprodução de bactérias nocivas e podem, portanto, ser utilizados para tratar a diarreia. Se o doente for tratado apenas com medicamentos anti-diarreia, não funcionará para inibir as bactérias nocivas, pelo que conduzirá a sintomas recorrentes de diarreia e poderá mesmo agravar os sintomas da diarreia. Os doentes com diarreia causada por uma infecção bacteriana ou viral clara podem também não conseguir alcançar o efeito desejado quando tratados apenas com medicação anti-diarreia ou com medicação anti-diarreia em combinação com probióticos. Recomenda-se que os doentes com infecções bacterianas claras sejam tratados com antibióticos, se necessário, para controlar a infecção, e medicamentos antivirais, se estiver presente uma infecção viral.