Não existem sintomas precoces de pielonefrite crónica. Os doentes com pielonefrite crónica podem apresentar uma dor vaga na zona lombar, frequência urinária intermitente e febre baixa. A pielonefrite crónica é mais complexa, as manifestações urinárias sistémicas e locais são atípicas e, por vezes, apenas se manifesta bacteriúria assintomática. Mais de metade dos doentes podem ter uma história de pielonefrite aguda, seguida de febre baixa, frequência urinária intermitente, desconforto urinário, dor lombar e comprometimento da função tubular renal, como noctúria, hipogranulonefrose, etc. A doença pode evoluir para pielonefrite crónica. A persistência da doença pode evoluir para insuficiência renal crónica. Os sintomas do doente são evidentes durante os ataques agudos, semelhantes aos da pielonefrite aguda. Os doentes com pielonefrite crónica são aconselhados a consultar um hospital regular e a receber tratamento normalizado sob a orientação de um médico.