A maioria das doenças cardíacas congénitas podem ser tratadas cirurgicamente e a maioria dos pacientes pode atingir um nível normal de função cardíaca após a cirurgia, mas o momento apropriado da cirurgia é importante. Recentemente, advoga-se que a cirurgia deve ser realizada antes da idade escolar, para que a aprendizagem da criança não seja afectada e a experiência psicológica da cirurgia numa idade precoce seja inferior à de uma criança mais velha, o que tem menos impacto no crescimento psicológico e físico da criança. Se a gravidade da lesão não permitir esperar, a cirurgia pode ser realizada mais cedo, mas a taxa de mortalidade é mais elevada. Como as crianças a partir dos 3 anos têm mais probabilidades de cooperar com a operação, recuperam mais rapidamente a seguir. Se se perder o melhor momento para a cirurgia, a criança pode ficar com diferentes graus de danos a outros órgãos, especialmente às artérias pulmonares, como a hipertensão pulmonar, e em casos graves a oportunidade de cirurgia pode ser perdida. Se a criança tiver menos de 2 anos de idade, algumas crianças podem fazer primeiro uma cirurgia paliativa, seguida de uma cirurgia correctiva mais tarde. Os doentes demasiado velhos, especialmente os com mais de 30 anos de idade, são mais susceptíveis de sofrer danos irreversíveis nos seus órgãos devido a uma sobrecarga cardíaca prolongada, o que aumenta o risco de cirurgia e impede-os de recuperar completamente depois. Se o seu filho for suspeito de ter uma doença cardíaca congénita, deve ser realizada uma ecografia do coração o mais cedo possível. Se a doença cardíaca congénita for confirmada, deve consultar um cirurgião cardíaco o mais cedo possível, que poderá aconselhá-lo sobre o momento mais adequado para a cirurgia.