Nos últimos anos, tem sido defendido que a cirurgia deve ser realizada antes da idade escolar (3-6 anos) de modo a não interferir com a aprendizagem da criança e, ao mesmo tempo, a experiência psicológica da criança é inferior à de uma idade mais avançada. Se a gravidade da lesão não permitir esperar, a cirurgia pode ser realizada mais cedo, mas a taxa de mortalidade é mais elevada. Se se perder o melhor momento para a cirurgia, a criança pode ficar com diferentes graus de danos a outros órgãos, especialmente às artérias pulmonares, como a hipertensão pulmonar, e em casos graves a oportunidade de cirurgia pode ser perdida. Se a criança tiver menos de 2 anos de idade, algumas crianças podem ter uma cirurgia paliativa e depois uma cirurgia correctiva numa data posterior. Os doentes demasiado velhos, especialmente os com mais de 30 anos de idade, são mais susceptíveis de sofrer danos irreversíveis nos seus órgãos devido a uma sobrecarga cardíaca prolongada, o que aumenta o risco de cirurgia e impede-os de recuperar completamente após a cirurgia. Está bem estabelecido que o tratamento na idade adulta é menos favorável do que na infância devido a mais complicações, recuperação mais lenta e mortalidade mais elevada. O momento da cirurgia é deixado ao critério do especialista.