A diarreia após a febre tem geralmente várias causas: em primeiro lugar, factores infecciosos, sendo geralmente os factores infecciosos a causa mais comum. Por exemplo, a gastroenterite aguda e a diarreia por intoxicação alimentar causada por uma dieta impura ou outras causas têm geralmente diarreia após uma febre, bem como apendicite aguda, pancreatite aguda e colecistite aguda, que também têm febre, seguida de sintomas clínicos tais como dor abdominal, diarreia, náuseas e vómitos. Em segundo lugar, as constipações gastrointestinais podem também apresentar febre seguida de diarreia, na sua maioria combinada com dores de cabeça, nariz entupido, corrimento nasal e outros sintomas de constipação. Em terceiro lugar, existem também factores de fitodisfunção gastrointestinal, tais como a síndrome do intestino irritável, que podem levar à febre e à diarreia.