Recomenda-se que o tratamento do canal radicular seja efectuado imediatamente após a remoção do nervo para evitar que as bactérias voltem a entrar no canal radicular e causem infecções periapicais e do canal radicular, conforme descrito abaixo. Um tratamento completo do canal radicular inclui a preparação do canal radicular, a desinfeção do canal radicular, a obturação do canal radicular, seguida da restauração do dente para isolar completamente as bactérias. Após a remoção do nervo, a medicação desinfetante é normalmente inserida no canal radicular, após o que a cavidade é temporariamente fechada utilizando vários tipos de cimento, tais como óxido de zinco eugenol, ionómero de vidro, etc. Estes materiais têm uma resistência limitada e partem-se se forem utilizados durante um longo período de tempo, e a saliva, os microrganismos, os resíduos alimentares, etc. entram no canal radicular, o que causará novamente infecções inflamatórias no canal radicular e na área periapical, afectando o efeito do tratamento. Recomenda-se a deslocação ao hospital para receber tratamento profissional.