A própria febre é um sintoma muito importante da doença de Kawasaki. Como a doença de Kawasaki pode ser causada por uma infecção que provoca uma resposta de activação auto-imune super-antigénica, a própria febre é uma manifestação da fisiopatologia. A gestão da febre é rotineiramente sintomática, com o medicamento antipirético ibuprofeno ou com antipiréticos convencionais como o acetaminofeno, que são utilizados para reduzir o calor. A gestão etiológica da doença de Kawasaki, ou seja, o uso de doses elevadas de gamaglobulina para selar anticorpos e aspirina para actuar como anticoagulante, curará naturalmente a febre se a gestão etiológica for boa. É importante dissipar a ideia errada de que quanto mais alta a temperatura da doença de Kawasaki, mais grave a doença se tornará ou maior a probabilidade de complicações.