O Agatroban é utilizado para melhorar a ulceração, dor de repouso e frieza nas extremidades superiores e inferiores em doentes com doença arterial oclusiva crónica, vasculite trombo-oclusiva e aterosclerose oclusiva; para melhorar os sintomas neurológicos e as actividades diárias, tais como andar e estar de pé em doentes com enfarte cerebral isquémico na fase aguda no prazo de 2 dias após o início. Agatroban é clinicamente indicado para: acidente vascular cerebral isquémico agudo; doença oclusiva arterial periférica crónica; terapia adjuvante para trombólise em doentes com enfarte do miocárdio; trombocitopenia induzida por heparina e síndromes trombóticas. Com este fármaco, deve ter-se o cuidado de o utilizar com precaução em doentes com hipertensão grave, após anestesia espinal e especialmente após grandes cirurgias; recomenda-se a redução da dose em doentes com insuficiência hepática que requerem argatrobanho, mas não é necessário ajuste da dose em doentes idosos e em doentes com insuficiência renal que utilizam argatrobanho.