O teste do esfregaço anal é utilizado principalmente para o diagnóstico de infecções do tracto gastrointestinal, especialmente disenteria bacteriológica, e é um meio de examinar pacientes que não podem passar as fezes. O esfregaço anal é realizado inserindo um tubo anal no ânus, rodando-o algumas vezes e depois retirando as fezes do ânus. Este teste é doloroso, especialmente em pacientes com lesões da mucosa rectal ou hemorróidas, e além de ser doloroso pode até ser sangrento. Os doentes infectados com disenteria tóxica podem apresentar febre alta, tensão arterial baixa e estado mental alterado, mas sem sintomas de diarreia. Isto é quando é necessário um esfregaço anal para recolher uma amostra de fezes para exame de rotina das fezes e cultura bacteriana. Se houver um grande número de glóbulos brancos e alguns glóbulos vermelhos nas fezes, isto pode ajudar no diagnóstico clínico de disenteria bacteriana. Naturalmente, é necessária uma cultura bacteriana de Bacillus dysenteriae para confirmar o diagnóstico de disenteria bacilar.