Se for determinado que se trata de um colesteatoma do ouvido, é primeiro necessário um TAC do ouvido para ver se se trata simplesmente de um colesteatoma do canal auditivo externo ou se há danos no ouvido médio. Se for um simples colesteatoma do canal auditivo externo, geralmente não é um problema grave e pode ser limpo sob anestesia local juntamente com o epitélio do colesteatoma, e depois o interior do ouvido pode ser comprimido com gaze oleosa para prevenir hemorragias e hiperplasia. No entanto, se o colesteatoma estiver no ouvido médio, terá de ser cortado e será realizada uma grande operação, caso contrário o colesteatoma crescerá demasiado para que a doença seja controlada, e pode também causar uma infecção no crânio, o que requer atenção. Há uma certa probabilidade de recidiva após a cirurgia ao colesteatoma. Após a cirurgia, demora geralmente cerca de 1-3 meses a ir ao hospital para limpar regularmente a cavidade antes da cirurgia, e para usar gotas anti-inflamatórias no ouvido localmente para controlar activamente a infecção.