As pílulas contraceptivas de emergência podem ter alguns efeitos secundários quando tomadas oralmente duas vezes seguidas. Os mais comuns incluem hemorragia de privação, menstruação precoce ou tardia e hemorragia vaginal irregular. Outros sintomas incluem náuseas, vómitos, sensibilidade mamária, dores de cabeça, tonturas, dores abdominais e fadiga. A presença ou ausência de hemorragia de privação após a toma da pílula não é um indicador de sucesso ou fracasso da contracepção. Embora a gravidez seja improvável após a toma da pílula, a pílula não é 100% eficaz. A pílula actua inibindo a ovulação, impedindo a fixação de um óvulo grávido e aumentando a consistência do muco cervical, aumentando a resistência à penetração dos espermatozóides e afectando o revestimento do útero, proporcionando assim um efeito contraceptivo de acção rápida. É importante notar que, depois de tomar a pílula contraceptiva de emergência, é necessário usar contraceptivos quando voltar a ter relações sexuais, caso contrário pode engravidar.