Se o quisto da tiroide for pequeno e desaparecer subitamente sem efeitos adversos, normalmente não é necessário qualquer tratamento especial. Se o quisto da tiroide for pequeno e não tiver qualquer reação adversa antes de desaparecer, e se não houver desconforto após o seu desaparecimento, normalmente não é necessário qualquer tratamento especial, sendo suficiente uma observação regular. Se o quisto da tiroide em si for enorme, desaparecendo temporariamente quando o pescoço é movimentado, mas reaparecendo depois, e for acompanhado de sintomas como dificuldade em engolir, dificuldade em comer, engasgamento e tosse ao beber, rouquidão, etc., é necessário um tratamento atempado para evitar que o quisto aumente gradualmente e comprima outros tecidos, o que produzirá reacções adversas. Os quistos da tiroide devem ser tratados logo que se detecte qualquer desconforto.