As causas da perturbação gástrica à 1h da manhã incluem, geralmente, úlcera duodenal, bulbitis duodenal e esofagite de refluxo, etc., que devem ser tratadas por um médico logo que detectadas. Como o sistema gastrointestinal é protegido pela membrana mucosa, geralmente não é atacado pelo ácido gástrico, mas quando a barreira protetora da membrana mucosa é danificada, ocorrem úlceras ou inflamação da mucosa, etc. Como o ácido gástrico do corpo humano é uma secreção ininterrupta, especialmente a meio da noite, quando o ácido gástrico está no pico da secreção, o ácido gástrico é mais propenso à irritação do revestimento gástrico, desencadeando o sintoma de desconforto gástrico. Além disso, alguns doentes com esofagite de refluxo também apresentam o fenómeno de desconforto gástrico a meio da noite, pelo que é melhor levantar a almofada ao dormir. Em caso de perturbações gástricas nocturnas repetidas, recomenda-se o tratamento hospitalar atempado, sob a orientação do médico, para um diagnóstico e tratamento normalizados.