Existem duas causas principais de medula óssea baixa, como segue: Em primeiro lugar, tem a ver com a operação, tal como uma falha na operação da punção óssea, ou devido à inalação de mais sangue durante a punção, ou a aspiração incompleta do tecido da medula óssea durante a punção. Em segundo lugar, a operação é correcta, mas existem de facto doenças da medula óssea, tais como anemia aplástica, ou fibrose da medula óssea, o que eventualmente causa uma redução da própria medula óssea. A causa clínica da mielofibrose não é clara.