Existe uma predisposição genética para a tiroidite de Hashimoto. No entanto, trata-se de uma doença autoimune crónica que ocorre como resultado da interação entre factores genéticos e imunitários. Embora a causa da tiroidite de Hashimoto não tenha sido totalmente esclarecida, estudos demonstraram que a tiroidite de Hashimoto tem uma certa predisposição genética e pertence a uma doença hereditária poligénica, em que o antigénio leucocitário humano é o gene de suscetibilidade, que tem um maior impacto nesta doença. No entanto, a tiroidite de Hashimoto não é causada apenas por factores genéticos. A tiroidite de Hashimoto é também uma doença autoimune crónica comum da tiroide, pelo que é geralmente considerada o resultado da interação de factores genéticos, imunitários e ambientais, tais como infecções microbianas patogénicas, medicamentos ou alimentos que contêm iodo, deficiência de iodo e radiação ambiental. Os doentes com tiroidite de Hashimoto têm de ser acompanhados regularmente, ter a sua função tiroideia verificada atempadamente e cooperar ativamente com os seus médicos o mais cedo possível para o tratamento, tendo geralmente um bom prognóstico.