Em geral, quanto maior for o tumor, maior é a incidência de lesões malignas. Para o TSM com um diâmetro máximo de >3 cm, recomenda-se actualmente a ressecção completa devido ao elevado risco de malignidade. No entanto, ainda existe uma falta de evidência clínica relativamente ao tratamento do TSM com um diâmetro máximo de ≤3 cm. A maioria dos TSM com um diâmetro máximo pequeno apresenta características benignas e raramente é maligna, tendo sido sugerido na literatura que os doentes com TSM com um diâmetro máximo pequeno podem ser seguidos regularmente. É importante notar que a SMT do esófago tem uma elevada prevalência de leiomiossarcoma liso e a incidência de lesões malignas é extremamente baixa, mesmo quando o tumor é grande. A SMT do intestino delgado é geralmente clinicamente significativa e a maioria é maligna, devendo ser ressecada uma vez identificada, independentemente do tamanho do tumor, embora este facto continue a ser controverso. O TSM rectal pode evoluir para um tumor neuroendócrino ou mesenquimal altamente maligno e deve ser ressecado logo que detectado, mas o TSM rectal com um diâmetro máximo <2 cm é predominantemente um tumor carcinóide sem risco de invasão e pode ser seguido regularmente.