Geralmente não existem sequelas após a ressecção ileocecal, mas alguns doentes podem apresentar aderências, risco de infeção e sequelas como má absorção de nutrientes e diarreia. A ressecção cirúrgica da região ileocecal resulta em aderências cicatriciais e aumenta o risco de obstrução intestinal adesiva. Os doentes que sintam desconforto e dor no local da cirurgia no abdómen devem procurar assistência médica o mais rapidamente possível. Após a ressecção do retalho ileocecal, o fluxo rápido do conteúdo do intestino delgado para o intestino grosso e o refluxo do conteúdo do ceco para o íleo não podem ser eficazmente evitados, o que irrita a parede intestinal e aumenta o risco de infeção. O final do íleo é o principal local de absorção de sais biliares, factores internos e vitamina B12, e após a ressecção da válvula ileocecal, o fluxo de nutrientes do íleo para o intestino grosso aumenta e a absorção de nutrientes diminui. Como a função da válvula ileocecal desapareceu após a operação, a diferença entre o ambiente e a flora no íleo e no jejuno diminuiu, o que facilmente levou à ocorrência de enterocolite e, portanto, fácil de manifestações de diarréia.