A gastroscopia é geralmente simples e requer um jejum de oito horas antes da gastroscopia para garantir que não há alimentos no estômago e facilitar a observação. O exame é realizado através de um tubo de borracha que passa pela boca e garganta, depois pelo esófago, pelo interior do estômago e pelo duodeno. Um sensor electrónico e uma fonte de luz, equivalente a uma câmara, são instalados na parte da frente do tubo e colocados no interior do estômago e do esófago, transmitindo imagens do interior para um ecrã electrónico onde o médico pode observar o que se passa no interior do estômago. A colonoscopia envolve também a utilização de um tubo, que é introduzido através do ânus no intestino, passando pelo intestino curvo até chegar ao ceco e ser observado. Oito horas antes da colonoscopia, é utilizado um laxante para limpar o tracto intestinal e garantir que o lúmen está limpo.