O peróxido de hidrogénio é utilizado para desinfectar feridas. O peróxido de hidrogénio, também conhecido como peróxido de hidrogénio, é utilizado com maior frequência durante o desbridamento cirúrgico. Depois de uma pessoa ter sido ferida pode haver sujidade ou corpos estranhos no interior da ferida, e pode mesmo haver bactérias, fungos, esporos, etc., pelo que o desbridamento é normalmente feito através de uma primeira limpeza com peróxido de hidrogénio. O objectivo da limpeza é matar bactérias no interior da ferida, incluindo fungos e possivelmente até bacilos de tétano. A ferida é normalmente lavada duas vezes por rotina e durante o processo de limpeza são produzidas muitas bolhas. Após o enxaguamento, o peróxido é então lavado com soro fisiológico e a ferida é então verificada quanto a qualquer sujidade no seu interior e, se assim for, é necessária uma limpeza posterior. Após a limpeza, a ferida é desinfectada duas vezes com iodophor e depois cosida.