O vinagre, como aromatizante, geralmente não tem efeitos secundários quando consumido com moderação no dia a dia, mas se beber muito vinagre, pode irritar o aparelho digestivo e causar refluxo ácido, náuseas e outros desconfortos. As pessoas que estão a tomar medicamentos ocidentais, as pessoas com excesso de ácido estomacal e as pessoas com alergias devem tentar não beber vinagre.
As pessoas que tomam medicamentos ocidentais geralmente não podem ingerir vinagre, pois o ácido acético afecta o nível de pH, o que faz com que certos medicamentos não tenham a capacidade de funcionar. Por exemplo, não é aconselhável comer vinagre quando se está a tomar medicamentos como a gastroparesia, o bicarbonato de sódio, etc., o que levará à ineficácia dos medicamentos.
As pessoas com excesso de ácido gástrico e os doentes com úlceras gástricas não devem, em geral, consumir vinagre. O vinagre leva os órgãos digestivos a segregar mais sucos digestivos, o que aumenta o efeito digestivo do ácido gástrico e pode levar à corrosão da mucosa gastrointestinal, podendo também agravar as úlceras gástricas.
Além disso, algumas pessoas são alérgicas ao vinagre e, depois de beberem vinagre, sofrem de asma, comichão, erupção cutânea e edema devido à alergia.
Em resumo, as pessoas normais que bebem vinagre geralmente não têm qualquer efeito, mas se estiver a tomar medicamentos ocidentais, se tiver excesso de ácido estomacal e se for alérgico, deve seguir os conselhos do médico e não consumir vinagre às cegas.