Nas fases iniciais da HFMD, os sintomas podem incluir febre, erupções cutâneas nas mãos e nos pés e uma erupção cutânea nas membranas mucosas da boca. Nos casos mais ligeiros, a febre pode não ultrapassar os 38 graus e não voltar durante alguns dias, ao passo que nos casos mais graves, a febre pode repetir-se e pode mesmo aumentar suficientemente depressa para provocar convulsões febris. É provável que a febre seja acompanhada por sintomas semelhantes aos da constipação, como espirros, corrimento nasal e tosse, bem como por sintomas gastrointestinais, como náuseas, vómitos e perda de apetite. A erupção cutânea na garganta provoca normalmente uma sensação mais dolorosa, que se agrava nos primeiros dias e atinge o seu pico nos dias 1-2 ou 3-4, após o que diminui gradualmente. A erupção cutânea nas mãos e nos pés começa como uma pápula vermelha e depois algumas das pápulas transformam-se em herpes, que normalmente é curto e pode sair num dia. Durante os primeiros 3-4 dias, é provável que a erupção cutânea continue a aparecer.