Os gémeos in vitro podem ser abortados. A gravidez gemelar pode levar a um aumento da incidência de complicações maternas e fetais, mas só pode ser abortada em circunstâncias especiais. A gravidez de gémeos pode levar a um aumento da incidência de complicações para a mãe, como hipertensão gestacional, eclâmpsia, diabetes gestacional, contracções fracas, bem como parto prematuro, restrição do crescimento fetal e síndrome de transfusão gemelar. Geralmente, a cirurgia de redução fetal pode ser realizada na presença de um útero cicatrizado, na presença de uma anomalia num dos fetos gémeos, de co-morbilidades maternas como o hipertiroidismo, de gravidezes demasiado curtas e de suspeita de insuficiência cervical. Se os gémeos de FIV quiserem reduzir o feto, isso deve ser feito sob o conselho de um médico para garantir a segurança da mãe e do feto.