A toma da pílula contraceptiva de emergência uma vez por mês pode provocar um atraso na menstruação, por vezes interrompendo-a e, em casos graves, causando infertilidade. A pílula contraceptiva de emergência não deve ser tomada mais de três vezes por ano e o seu conteúdo hormonal é muito elevado. Na prática clínica, há médicos que utilizam a pílula para tratar doentes ginecológicas, como menstruação prematura, menstruação irregular, gonorreia, os médicos pedem às doentes que tomem a pílula ou quando há um desequilíbrio ou falta de hormonas no corpo, a pílula também é utilizada para tratamento, mas a pílula é um contraceptivo de acção curta com um baixo conteúdo hormonal e é tomada de acordo com o ciclo menstrual. Os contraceptivos de longa duração são tomados uma vez por mês e inibem a função ovárica e, após a interrupção da pílula, podem levar à menopausa, que demora vários meses a recuperar.