A cirurgia de quistos na região da sela do cérebro pode ser perigosa e requer um médico especialista para planear a cirurgia e garantir a sua segurança. Em qualquer cirurgia no cérebro, existem riscos. A cirurgia de tumores da região da sela é relativamente mais arriscada do que noutras partes do cérebro porque há mais tecidos cerebrais e nervos na região e a localização é mais profunda, e há muitas estruturas nervosas e vasos sanguíneos importantes nos órgãos vizinhos, pelo que a dificuldade da cirurgia e o risco de hemorragia são maiores do que noutras partes do cérebro. Além disso, existem riscos anestésicos associados à cirurgia do quisto da sela. Com os recentes avanços na compreensão da anatomia da região da sela e com os avanços nas técnicas microcirúrgicas, as técnicas cirúrgicas melhoraram e os riscos foram grandemente reduzidos. Recomenda-se que os doentes com quistos da região da sela colaborem com os seus médicos, a fim de melhorar o seu prognóstico.