A eritrocitose pode ser tratada com quimioterapia, cujo principal objectivo é baixar a contagem de glóbulos vermelhos e reduzir a viscosidade do sangue. Normalmente, em primeiro lugar, a aspirina é utilizada para combater a coagulação plaquetária e, em segundo lugar, a quimioterapia pode ser utilizada para controlar a contagem de eritrócitos. Os medicamentos mais utilizados são a hidroxiureia, a leucovorina e a hipertrigonelina. O tratamento com estes fármacos deve ser monitorizado regularmente para evitar que os glóbulos brancos caiam demasiado baixo e causem infecções. O interferão pode ser usado se disponível e os inibidores de JAK2 como o ruxolitinibe podem ser usados se houver uma mutação do gene JAK2.