O sistema digestivo dos bebés e crianças pequenas ainda não está maduro, por isso, se comerem demasiado ou com demasiada frequência, aumentará a carga sobre o tracto gastrointestinal e os intestinos não serão capazes de se adaptar às alterações, o que conduzirá a perturbações digestivas. Em caso de alimentação manual, a temperatura da água do leite artificial é demasiado baixa ou demasiado alta, mudança frequente de leite artificial, tempo de alimentação irregular, etc., tudo isto conduzirá a disfunções do ambiente intestinal, causando desequilíbrio da flora intestinal e indigestão. A fórmula de alimentação artificial carece de IgA secretora e de outros factores humorais contidos no leite materno e é fraca contra infecções. Ao mesmo tempo, a alimentação artificial e os utensílios alimentares são facilmente contaminados, o que pode levar a infecções intestinais e indigestão.